As microcistinas são toxinas libertadas pelas cianobactérias. A sua denominação deve-se ao facto de terem sido inicialmente detetadas na espécie Microcystis aeruginosa, embora depois outras espécies tenham revelado também a capacidade de produzir este tipo de toxina. [7] O género Microcystis é o que mostra uma distribuição mundial mais alargada em massas de água eutróficas e hipereutróficas, sendo este em Portugal o género mais comum. [8]

 

 

As cianotoxinas, são classificadas de acordo com o local onde provocam mais efeitos [9]: